More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2341 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  88.32 
 
 		 433 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  98.11 
 
 		 430 aa  867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  78.6 
 
 		 436 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  82.08 
 
 		 439 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  76.85 
 
 		 438 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  77.08 
 
 		 438 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  98.58 
 
 		 424 aa  870    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  78.59 
 
 		 411 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 424 aa  882    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  68.67 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  70.05 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  68.88 
 
 		 377 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  67.9 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  61.85 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  65.96 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  59.79 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  54.44 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  51.08 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  49.25 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  48.66 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.85 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  45.65 
 
 		 409 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  43.16 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  44.09 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 417 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  39.38 
 
 		 430 aa  312  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  40.86 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  42.78 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  38.9 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  41.13 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  41.13 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.14 
 
 		 457 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 474 aa  289  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.63 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  40.64 
 
 		 720 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  39.3 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.38 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.49 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  37.94 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  40.56 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  37.19 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.63 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 451 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  39.14 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  37.1 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.89 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  36.49 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  35.76 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  36.47 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 438 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  39.04 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.54 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.17 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  38.31 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  39.41 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.58 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  37.01 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  39.94 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.61 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  38.02 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  33.89 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.83 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.22 
 
 		 323 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  37.36 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  39.73 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  35.95 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  35.77 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  38.05 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>