More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3272 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  97.71 
 
 		 393 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 393 aa  766    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  92.11 
 
 		 400 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  72.96 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  67.66 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  68.55 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 409 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  48.52 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  46.49 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  48.53 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  48.24 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  47.98 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  48.8 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  48.8 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  47.71 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  47.98 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  45.69 
 
 		 445 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  47.59 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  45.21 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  45.69 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  46.91 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  45.14 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  47.11 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  45.9 
 
 		 419 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  48.17 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  47.17 
 
 		 448 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  46.75 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40.86 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  45.17 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  46.52 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  43.29 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  47.61 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  42.78 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  45.74 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.76 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  46.54 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  46.05 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  42.27 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  45.53 
 
 		 434 aa  292  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  43.51 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  43.77 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.11 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  47.55 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  41.41 
 
 		 469 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  47.01 
 
 		 466 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  44.3 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  48.8 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  45.62 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  44.3 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  42.67 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  42.36 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 451 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  44.86 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  44.48 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  40.62 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 470 aa  272  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.87 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  43.57 
 
 		 720 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  41.05 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.39 
 
 		 462 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  44.39 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  43.43 
 
 		 429 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  42.7 
 
 		 422 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  39.95 
 
 		 412 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  42.3 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  42.07 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  43.47 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  44.35 
 
 		 411 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  40.86 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  39.41 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  41.77 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  44.32 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  41 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  39.44 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 		 486 aa  256  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  42.67 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.47 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  38.73 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.63 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  39.35 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>