More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 438 aa  882    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  65.31 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  64.85 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  65.45 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  65.67 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  65.9 
 
 		 438 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  65.9 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  62.56 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  65.44 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  61.61 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  59.27 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  64.6 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  46.17 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  49.11 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  50.67 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.5 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  50.94 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  50.4 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  50.82 
 
 		 430 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  51.61 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  48.4 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  49.06 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  47.61 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  48.21 
 
 		 466 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  50.27 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  49.19 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  47.8 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  47.16 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  47.29 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  46.19 
 
 		 398 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  45.02 
 
 		 422 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  49.47 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  46.86 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  46.4 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  44.97 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  46.4 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.63 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  45.43 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  47.48 
 
 		 454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  46.35 
 
 		 413 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  46.83 
 
 		 413 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  46.72 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.95 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  45.62 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  47.01 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  43.28 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  46.67 
 
 		 720 aa  329  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  46.88 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  42.39 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  42.11 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  45.68 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 481 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  45.13 
 
 		 461 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  46.17 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  43.2 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  48.72 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  48.92 
 
 		 393 aa  319  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  44.38 
 
 		 443 aa  319  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.63 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.88 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  47.43 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46.61 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  47.3 
 
 		 514 aa  316  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  45.5 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  45.4 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  41.83 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.34 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  42.72 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  47.68 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  43.52 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  47.73 
 
 		 392 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  45.58 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  42.78 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  48.79 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  43.16 
 
 		 491 aa  299  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  41.5 
 
 		 407 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.33 
 
 		 395 aa  294  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  42.37 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  42.82 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  42.67 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  41.54 
 
 		 433 aa  289  9e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  41.22 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  45.76 
 
 		 486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.28 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.44 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.26 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 418 aa  280  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  45.92 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.55 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>