More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2522 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 406 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  48.64 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  44.35 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  42.05 
 
 		 445 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  43.82 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  44.39 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  43.82 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  48.9 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  42.78 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  45.6 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  45.31 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  46.98 
 
 		 438 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  43.77 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  42.47 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  45.58 
 
 		 434 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  46.58 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  42.51 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  43.7 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  45.98 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  44.05 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.33 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  44.88 
 
 		 514 aa  282  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  44.26 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  42.82 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  39.44 
 
 		 409 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  43.41 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  41.24 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  36.32 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  44.63 
 
 		 413 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.63 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  40.54 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  42.34 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  42.04 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  43.04 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  42.3 
 
 		 430 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  41.14 
 
 		 405 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 430 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  44.03 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  42.04 
 
 		 469 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.5 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.23 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  37.63 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  34.01 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.42 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.42 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  41.04 
 
 		 400 aa  252  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  41.96 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  40.06 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.92 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40.24 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  41.14 
 
 		 481 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.25 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.83 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  41.69 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.5 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.84 
 
 		 395 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  37.63 
 
 		 412 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  40.06 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  40.06 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  40.83 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.16 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  36.75 
 
 		 443 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  40.76 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  37.73 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  40.49 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>