More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4208 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  98.16 
 
 		 398 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  100 
 
 		 398 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  68.77 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  67.2 
 
 		 720 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  63.33 
 
 		 400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  57.4 
 
 		 404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  56.41 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  56.41 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  55.58 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  56.31 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  55.58 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  55.9 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  56.15 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  52.73 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  50.51 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  50.25 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  50.39 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  48.44 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  48.93 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  45.85 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  47.26 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  47.85 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  48.46 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  46.89 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  48.46 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  49.6 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  48.79 
 
 		 438 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  47.95 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  49.34 
 
 		 448 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  46.52 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  46.9 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  46.11 
 
 		 481 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  46.31 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  46.36 
 
 		 438 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  45.55 
 
 		 445 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  48.08 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  47.53 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  45.8 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  45.95 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  45.29 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  45.14 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  46.88 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  44.24 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  43.38 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  46.4 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.63 
 
 		 462 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  45.04 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46.63 
 
 		 413 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  44.27 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  43.88 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  41.71 
 
 		 395 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 470 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 438 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 411 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 410 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.71 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  45.68 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  41.32 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  40.75 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  41.97 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.01 
 
 		 466 aa  295  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 377 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.78 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.21 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  43.94 
 
 		 514 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.7 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  42.22 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  42.36 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  40.9 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.52 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  42.05 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.63 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  39.79 
 
 		 413 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  44.3 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  43.67 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  40.74 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 409 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  43.82 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 392 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  39.89 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  39.25 
 
 		 412 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  39.95 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  38.04 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>