More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3314 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 407 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  96.07 
 
 		 407 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  75.94 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  72.97 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  54.55 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  56.57 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  56.06 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  57.54 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  49.87 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  44.82 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  44.84 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  43.95 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  43.95 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 448 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  43.68 
 
 		 438 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 413 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  41.95 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  43.12 
 
 		 445 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  42.04 
 
 		 413 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  41.87 
 
 		 418 aa  295  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  42.02 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  41.63 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  42.44 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  43.77 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  42.59 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.31 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  42.34 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  42.53 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 438 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.88 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  44.74 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  41.78 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  42.4 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  40.93 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  41.64 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  40.99 
 
 		 464 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40.53 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  40.46 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  39.47 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  42.17 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  42.13 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  41.01 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  42.63 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  41.27 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 409 aa  272  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  41.67 
 
 		 720 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  42.2 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  40.9 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  40.36 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  42.89 
 
 		 419 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  40.15 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  41.29 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  40.46 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  42.48 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  40.32 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.64 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.44 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  41.44 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  41.98 
 
 		 392 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  40.64 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  41.18 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  38.82 
 
 		 491 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  38.52 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  42.52 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  42.44 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  40.95 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  39.71 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 477 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 474 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  37.71 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.89 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  38.4 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>