More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1706 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 454 aa  883    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  51.8 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  51.03 
 
 		 466 aa  360  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  50.53 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  45.55 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  48.24 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  47.03 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  46.87 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  49.33 
 
 		 438 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  50.26 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  46.05 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  49.33 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  51.26 
 
 		 457 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  48.61 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  48.4 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  44.5 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  47.64 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  49.47 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  49.33 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  47.16 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  50.67 
 
 		 418 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  46.79 
 
 		 401 aa  340  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  47.34 
 
 		 438 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  43.18 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  44.35 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  44.89 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  42.66 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  49.47 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  45.43 
 
 		 395 aa  326  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  42.2 
 
 		 439 aa  325  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  48.01 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 411 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  42.04 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  43.44 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  39.25 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  45.23 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  42.86 
 
 		 413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  48.27 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 		 432 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  48.41 
 
 		 419 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  43.28 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.37 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44.68 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  41.15 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  43.78 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  45.73 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.52 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  45.55 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  39.3 
 
 		 435 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.59 
 
 		 462 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  44.33 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  45.34 
 
 		 411 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  44.39 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  37.2 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  40.36 
 
 		 398 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  43.04 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  42.68 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  44.01 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  41.22 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  41.38 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 393 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  41.6 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  45.12 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  42.63 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  47.86 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  42.93 
 
 		 720 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  40.36 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  41.21 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  43.08 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  38.97 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 419 aa  266  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.09 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  42.16 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  41.09 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  42.33 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  45.62 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  40.98 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.49 
 
 		 323 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  40.2 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  38.97 
 
 		 451 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  38.72 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>