More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0662 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  94.24 
 
 		 434 aa  840    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 433 aa  884    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  64.79 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  42.97 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  41.41 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 		 466 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.89 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  42.2 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 440 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 474 aa  279  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.5 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.83 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.55 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  40.1 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  37.32 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 409 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  39.78 
 
 		 514 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  40.66 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  40.42 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.04 
 
 		 409 aa  256  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.27 
 
 		 462 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.71 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  39.84 
 
 		 720 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  38.12 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  38.74 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  36.68 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  36.68 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  39.33 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  38.97 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  36.87 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  36.6 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  38.4 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 398 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  36.84 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.72 
 
 		 422 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.83 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.29 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 454 aa  229  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.7 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.2 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 		 425 aa  223  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  38.72 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  33.96 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.73 
 
 		 439 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  37.81 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.69 
 
 		 401 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.91 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 398 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.56 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.87 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  34.62 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.62 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  37.46 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  36.5 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  35.28 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  36.46 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  36.89 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.7 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>