More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0691 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  100 
 
 
434 aa  889    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  94.24 
 
 
433 aa  840    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  64.11 
 
 
445 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  41.97 
 
 
457 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 
427 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.05 
 
 
470 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  41.3 
 
 
448 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.85 
 
 
430 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  42.19 
 
 
466 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  43.68 
 
 
448 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.12 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.37 
 
 
438 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.37 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  41.44 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.03 
 
 
417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  40.82 
 
 
445 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.01 
 
 
415 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.68 
 
 
445 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  41.34 
 
 
438 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.81 
 
 
417 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 
434 aa  279  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  41.11 
 
 
419 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 
455 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  41 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  39.41 
 
 
440 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  42.16 
 
 
418 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  39.09 
 
 
432 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 
421 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  40.83 
 
 
514 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 
429 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 
409 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 
424 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  37.64 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.97 
 
 
462 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 
413 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 
416 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  39.89 
 
 
720 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.98 
 
 
411 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  37.12 
 
 
413 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  39.89 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.02 
 
 
410 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 
430 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 
404 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  38.95 
 
 
398 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  38.4 
 
 
398 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 
422 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 
413 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 
419 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  36.99 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  38.4 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 
413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.29 
 
 
407 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 
434 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 
423 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
418 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 
398 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 
398 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 
486 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  36.01 
 
 
428 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.84 
 
 
405 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  36.29 
 
 
427 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 
454 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  40.06 
 
 
407 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.56 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 
396 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 
430 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.41 
 
 
401 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 
398 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 
443 aa  223  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.83 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.73 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  38.23 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  37.7 
 
 
406 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 
424 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  34.5 
 
 
425 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 
395 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  34.75 
 
 
407 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  34.24 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  36.71 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  33.66 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 
377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  36.28 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 
461 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 
405 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  34.47 
 
 
395 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  34.88 
 
 
412 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  36.86 
 
 
464 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  34.93 
 
 
437 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 
400 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 
469 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>