More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1213 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 417 aa  844    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  58.27 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  49.32 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  47.58 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  44.56 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  43.32 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  44.92 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  45.38 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  43.04 
 
 		 401 aa  319  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  42.32 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  43.49 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 430 aa  315  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  41.88 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  42.22 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  41.62 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  43.94 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  40.63 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  43.09 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  43.48 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  40.1 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  39.25 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.58 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  41.6 
 
 		 427 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  41.6 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  42.39 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  41.44 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 455 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  42.12 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  40.97 
 
 		 445 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  40.92 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.44 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 438 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.32 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  40.85 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 413 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  39.55 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.76 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  40.46 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  42.27 
 
 		 413 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.55 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  41.99 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  41.02 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  41.84 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  38.66 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 393 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  37.5 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  39.3 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  39.15 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.8 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.8 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  37.9 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 		 396 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  39.06 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  36.02 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  34.92 
 
 		 412 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  35.81 
 
 		 434 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  34.67 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  39.01 
 
 		 720 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  35.95 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  36.9 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.63 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 		 470 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  35.98 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 349 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.1 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  42.42 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>