More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01388 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  100 
 
 
323 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  94.12 
 
 
323 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  75.54 
 
 
323 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  62.23 
 
 
324 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  56.38 
 
 
347 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  60.2 
 
 
349 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  53.75 
 
 
323 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  52.34 
 
 
331 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  50.34 
 
 
346 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  47.99 
 
 
362 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  47.99 
 
 
361 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  47.65 
 
 
362 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  47.19 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 
331 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  47 
 
 
370 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  46.67 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  43.08 
 
 
409 aa  288  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  46.33 
 
 
370 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  46 
 
 
370 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
438 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  39.48 
 
 
436 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.08 
 
 
396 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 
377 aa  265  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  39.4 
 
 
438 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  42.41 
 
 
333 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  43.05 
 
 
400 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 
439 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  42.41 
 
 
333 aa  261  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.46 
 
 
421 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  41.77 
 
 
333 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.69 
 
 
333 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.57 
 
 
401 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
329 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 
333 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 
424 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 
424 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  43.62 
 
 
454 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.54 
 
 
395 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 
395 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.46 
 
 
433 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 
428 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  38.39 
 
 
320 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  38.39 
 
 
320 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 
437 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.91 
 
 
395 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
438 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 
415 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 
409 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 
430 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  39.54 
 
 
470 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  39.37 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  40.4 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 
417 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.63 
 
 
417 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.61 
 
 
419 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.34 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 
438 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 
427 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  40.07 
 
 
445 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  40.2 
 
 
448 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 
440 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 
438 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 
438 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.27 
 
 
457 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 
424 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 
438 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 
438 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 
421 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  38.44 
 
 
448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  37 
 
 
455 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 
432 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2182  putative transglycosylase  37.05 
 
 
329 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00884137  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.08 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 
434 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.18 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.33 
 
 
422 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  36.72 
 
 
434 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  39.09 
 
 
418 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 
398 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 
466 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37 
 
 
720 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  34.08 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  36.3 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 
404 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 
319 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  34.58 
 
 
398 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 
393 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 
393 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  36.4 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 
429 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.42 
 
 
398 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 
398 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  36.58 
 
 
398 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1631  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.74 
 
 
329 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00716763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>