More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0024 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
330 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  45.12 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.39 
 
 
333 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  45.76 
 
 
454 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 
333 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  39.13 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  38.26 
 
 
324 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41 
 
 
377 aa  245  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  38.8 
 
 
320 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40.61 
 
 
409 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  40.94 
 
 
439 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.91 
 
 
396 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
395 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.23 
 
 
424 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.37 
 
 
323 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  45.87 
 
 
470 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.03 
 
 
323 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
428 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 
438 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  43.42 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 
438 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  37.29 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.31 
 
 
455 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 
438 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  36.96 
 
 
347 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  44.88 
 
 
457 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  46.54 
 
 
419 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 
323 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 
436 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 
438 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  42.81 
 
 
422 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  41.84 
 
 
346 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.92 
 
 
411 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 
438 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  43.14 
 
 
434 aa  228  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 
424 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  41.5 
 
 
421 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  40.96 
 
 
398 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  37.07 
 
 
323 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 
395 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 
430 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  38.87 
 
 
424 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.29 
 
 
400 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  41.36 
 
 
417 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.07 
 
 
415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  44.59 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  40.61 
 
 
398 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.46 
 
 
401 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  45.59 
 
 
415 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.62 
 
 
462 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  42.62 
 
 
413 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.21 
 
 
433 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  40.73 
 
 
440 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  40.06 
 
 
405 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 
410 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  42.57 
 
 
474 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.24 
 
 
421 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  42.28 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  42.57 
 
 
425 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  40.76 
 
 
448 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  39.19 
 
 
445 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 
435 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  40.06 
 
 
448 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 
400 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.85 
 
 
445 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 
437 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 
466 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  40.84 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  39.38 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39.08 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  39.88 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  41.19 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 
417 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  42.03 
 
 
430 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  43.3 
 
 
400 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
404 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  40.34 
 
 
720 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
362 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
361 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
362 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  40.34 
 
 
395 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 
405 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  42.27 
 
 
393 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  43.13 
 
 
432 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 
392 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  37.63 
 
 
427 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 
405 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 
398 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 
429 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 
419 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  40.26 
 
 
409 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.09 
 
 
474 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  38.13 
 
 
464 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  37.76 
 
 
411 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>