More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2119 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  99.45 
 
 		 362 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 361 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  99.17 
 
 		 362 aa  743    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  68.83 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.06 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  45.65 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.99 
 
 		 323 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 323 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  46.1 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  46.31 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  47.97 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  46.42 
 
 		 323 aa  299  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  41.25 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.75 
 
 		 396 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 411 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 370 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  43.58 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  40.63 
 
 		 370 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  41.32 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  40.32 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  40.2 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 		 454 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  36.06 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.11 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.86 
 
 		 433 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.69 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.76 
 
 		 409 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.53 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.76 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.96 
 
 		 445 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  40.45 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.08 
 
 		 448 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.9 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  42.05 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.34 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  42.37 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.69 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  38.01 
 
 		 422 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  38.66 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.04 
 
 		 363 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.05 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.98 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  38.34 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  38.06 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 451 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  38.87 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  34.95 
 
 		 329 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 		 474 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  36.68 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  38.38 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  39.19 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  35 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  38.85 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 481 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 429 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 470 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  38.57 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.46 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  38.57 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>