More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2380 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  100 
 
 		 333 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  96.1 
 
 		 333 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  95.8 
 
 		 333 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  66.77 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  66.77 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  66.47 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  66.16 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  50.31 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  50.15 
 
 		 333 aa  315  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  47.85 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  44.96 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  45.12 
 
 		 322 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2182  putative transglycosylase  48.55 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00884137  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1631  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.64 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00716763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.59 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.41 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  40.12 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  46.2 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  45.21 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  42.09 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  40.91 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  41.74 
 
 		 331 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  38.51 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.04 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 		 395 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 438 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 436 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 411 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 438 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  34.5 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.09 
 
 		 421 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  34.37 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  33.89 
 
 		 400 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.57 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  32.68 
 
 		 439 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  30.92 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  32.38 
 
 		 430 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  32.05 
 
 		 424 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  31.73 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.27 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  33.44 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  32.13 
 
 		 417 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.65 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  32.68 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  31.75 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  30.9 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  30.9 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  31.33 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  32.18 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  29.54 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  32.81 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  33.92 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  29.04 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  29.06 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  30.1 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  30.84 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  32.01 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  30.19 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  31.15 
 
 		 430 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 438 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  33.1 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  32.76 
 
 		 466 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  31.01 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  30.07 
 
 		 424 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  32.36 
 
 		 418 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  31.19 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  30.9 
 
 		 470 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  30.98 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  30.55 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  31.02 
 
 		 435 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  29.21 
 
 		 720 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.98 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  29.33 
 
 		 427 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  30.03 
 
 		 411 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  32.28 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 398 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 		 429 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  31.39 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  31.54 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  28.96 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  30.89 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  29.97 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  29.55 
 
 		 434 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  31.29 
 
 		 434 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  32.01 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  31.19 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  30.3 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  32.38 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  29.14 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  29.72 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  32.34 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>