More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0968 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 319 aa  641    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  45.12 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  44.11 
 
 		 421 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  44.44 
 
 		 417 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 419 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  40.92 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  43.39 
 
 		 400 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.38 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  39.6 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  39.6 
 
 		 398 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  39.06 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.96 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  39.06 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 		 438 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 		 438 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  39.87 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.56 
 
 		 438 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 396 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.66 
 
 		 421 aa  205  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  38.93 
 
 		 435 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.31 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  38.13 
 
 		 439 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.38 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 		 438 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.53 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  42.14 
 
 		 470 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 437 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  40.91 
 
 		 448 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.54 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  36.63 
 
 		 377 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.96 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.22 
 
 		 466 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  41.22 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.76 
 
 		 398 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  39.47 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  38.02 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  35.03 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.42 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 		 415 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  41 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  39.46 
 
 		 720 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  34.8 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 409 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  34.8 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.71 
 
 		 363 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  36.34 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.46 
 
 		 430 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.72 
 
 		 417 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  40.07 
 
 		 398 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  34.46 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 		 418 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 395 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.91 
 
 		 392 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.15 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 		 438 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  41.08 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  34.58 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 398 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.67 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.37 
 
 		 462 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.42 
 
 		 427 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  34.85 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  34.57 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  39.06 
 
 		 430 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  40.34 
 
 		 411 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  34.19 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.16 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 393 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  39.56 
 
 		 429 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  39 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  35.83 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  34.45 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  36.64 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>