More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1944 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 339 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1254  lytic murein transglycosylase  61.76 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0481  lytic murein transglycosylase  56.52 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0581873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 		 470 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.86 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  39.24 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.86 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 438 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.2 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  38.79 
 
 		 448 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  38.34 
 
 		 448 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.12 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.25 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.44 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.65 
 
 		 430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 424 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  37.78 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 474 aa  196  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 		 424 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 466 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  32.52 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.94 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 409 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.81 
 
 		 438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  32.84 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  43.49 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 		 438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.49 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  34.58 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  37.81 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  37.46 
 
 		 330 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  38.91 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.2 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  32.29 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  34.5 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  34.27 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.8 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  34.27 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  38.66 
 
 		 418 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  34.08 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  34.16 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  39.4 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  34.67 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.29 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  34.71 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  34.7 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.12 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  38.13 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  37.69 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.96 
 
 		 445 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  32.74 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.49 
 
 		 393 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.34 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  37.94 
 
 		 422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 419 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.82 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  37.26 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  39.37 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  34.73 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  37.01 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  37.06 
 
 		 477 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.41 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  34.31 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  37.77 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 440 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  36.63 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  36.89 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  37.04 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  35.95 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  33.43 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  39.38 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  33.05 
 
 		 427 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  36.13 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>