More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4073 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  93.14 
 
 		 477 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 423 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  69.83 
 
 		 412 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  67.17 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  59.61 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  59.8 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  60 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  57.38 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  42.97 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  42.22 
 
 		 419 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  41.87 
 
 		 411 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  41.87 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  41.53 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.5 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.66 
 
 		 419 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  38.81 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.76 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  38.52 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.28 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.68 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  36.28 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  36.99 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  35.04 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  37.24 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 443 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 407 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.24 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.98 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.11 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  36.1 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 438 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.86 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 486 aa  233  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  36.98 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.22 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.8 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  35.66 
 
 		 415 aa  229  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  37.89 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  36.96 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  42.31 
 
 		 491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  35.94 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 		 440 aa  226  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  35.16 
 
 		 457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.67 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.82 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.55 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  38.3 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.82 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.73 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.89 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  34.87 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  31.91 
 
 		 455 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  36.75 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.36 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  35.61 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.08 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  34.57 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  32.79 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  35.28 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  34.36 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  33.65 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.38 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>