More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4393 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 477 aa  982    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  93.14 
 
 		 423 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  69.83 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  66.67 
 
 		 418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  59.19 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  59.31 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  60.31 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  56.9 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  41.84 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  41.23 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  41.73 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  42.3 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  40.15 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  40.91 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 415 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.45 
 
 		 417 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 417 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  39.05 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  39.05 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  35.41 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.79 
 
 		 421 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  37.03 
 
 		 412 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.08 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 438 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.17 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  36.97 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 438 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.18 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  38.8 
 
 		 418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 		 443 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.72 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.5 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.92 
 
 		 404 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.06 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  36.18 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.4 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39.23 
 
 		 398 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.46 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.14 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 429 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 400 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 413 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.73 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.81 
 
 		 401 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.48 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.53 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  36.41 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 		 430 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.42 
 
 		 462 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  35.23 
 
 		 470 aa  223  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  34.11 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.67 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.64 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.84 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.36 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  36.21 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 396 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  34.72 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 400 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  35.59 
 
 		 400 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.69 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 474 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  37.46 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  34.46 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  40.6 
 
 		 320 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  40.6 
 
 		 320 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  35.28 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  34.41 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>