More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3093 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 422 aa  847    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  57.53 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  45.92 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  43.01 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.99 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  43.01 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.99 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  41.55 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.73 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  38.3 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  40.79 
 
 		 445 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  42.7 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  41.19 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  42.2 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  38.2 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.22 
 
 		 418 aa  255  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.49 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.48 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  37.69 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 470 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 466 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.21 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  37.67 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 421 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  39.4 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  36.87 
 
 		 405 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.22 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.71 
 
 		 407 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  39.04 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  37.96 
 
 		 398 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  37.53 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.55 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  39.11 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  38.93 
 
 		 454 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  38.25 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.77 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  34.48 
 
 		 427 aa  229  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  36.84 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.23 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  34.61 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 464 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 		 429 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  36.25 
 
 		 481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 434 aa  226  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  34.72 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37.89 
 
 		 720 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  37.06 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.92 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.38 
 
 		 421 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  35.04 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  34.45 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  33.99 
 
 		 427 aa  222  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  34.86 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.33 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.01 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 438 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  34.19 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.18 
 
 		 462 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  36.34 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.79 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>