More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2907 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  86.87 
 
 		 419 aa  751    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  76.11 
 
 		 442 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 419 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  76.6 
 
 		 414 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  76.67 
 
 		 393 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  79.74 
 
 		 415 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  77.81 
 
 		 411 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  76.18 
 
 		 409 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  45.31 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 418 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  40.15 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  42.22 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  41.94 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 477 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 412 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  38.31 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  38.07 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.78 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.08 
 
 		 427 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.46 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 		 422 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  39.18 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 481 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  36.71 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  39.69 
 
 		 392 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.92 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.45 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  35.09 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  34.79 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.56 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  35.36 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  34.21 
 
 		 464 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  35.36 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 455 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  38.68 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  33.25 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  36.34 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  35.65 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  36.43 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  36.04 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.6 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  34.63 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 439 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.34 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  36.1 
 
 		 486 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 466 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.11 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.07 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  31.49 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  33.59 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  32.21 
 
 		 424 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.21 
 
 		 433 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  32.98 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  32.21 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  33.07 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  34.7 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  34.14 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  30.81 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  34.9 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  32.59 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  33.07 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  32.8 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  36.06 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  36.13 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  31.53 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  33.07 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  32.38 
 
 		 377 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  34.59 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  33.33 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.3 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  32.72 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  30.85 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>