More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2846 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  99.06 
 
 
320 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  60.19 
 
 
333 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  59.87 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
349 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  41.25 
 
 
323 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  44.55 
 
 
448 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  44.7 
 
 
448 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  42 
 
 
438 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  42 
 
 
438 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  42 
 
 
438 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  42 
 
 
438 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
409 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.13 
 
 
323 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
434 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.92 
 
 
470 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.39 
 
 
323 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 
323 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 
331 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  37.88 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 
438 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
377 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  40.37 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 
421 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  38.8 
 
 
330 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  41.3 
 
 
417 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 
400 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 
419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  42.95 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.25 
 
 
454 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  41.14 
 
 
440 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.39 
 
 
401 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  41.45 
 
 
411 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.86 
 
 
432 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  37.38 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 
457 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.56 
 
 
433 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.41 
 
 
462 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.91 
 
 
445 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 
409 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  39.09 
 
 
413 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.91 
 
 
445 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 
438 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.71 
 
 
430 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 
395 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.54 
 
 
421 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.08 
 
 
424 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  41.08 
 
 
435 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 
430 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 
424 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  37.95 
 
 
422 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  38.49 
 
 
455 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.87 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.34 
 
 
400 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 
427 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 
474 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 
438 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 
438 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.12 
 
 
428 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 
411 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 
346 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 
417 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38 
 
 
415 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 
395 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  39.87 
 
 
434 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39.93 
 
 
466 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 
395 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 
424 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 
439 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 
393 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  39.33 
 
 
331 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  40.44 
 
 
407 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.88 
 
 
398 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 
393 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  37.72 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  39.93 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  39.06 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.22 
 
 
398 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 
392 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  34.98 
 
 
410 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 
415 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  35.62 
 
 
720 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  37.67 
 
 
413 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  34.08 
 
 
437 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 
477 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 
413 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
418 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
413 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  38.85 
 
 
361 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 
423 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  38.51 
 
 
362 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  41.02 
 
 
391 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 
362 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  35.43 
 
 
412 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  37.46 
 
 
427 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 
406 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  35.91 
 
 
419 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  37.46 
 
 
427 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  36.1 
 
 
443 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  34.53 
 
 
425 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>