More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0157 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 418 aa  854    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  68.04 
 
 		 412 aa  591  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  65.7 
 
 		 423 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  66.67 
 
 		 477 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  57.78 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  55.83 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  56.46 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  52.17 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  43.94 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  44.29 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  41.61 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  43.78 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  40.98 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 427 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.16 
 
 		 417 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 454 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 419 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.71 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.83 
 
 		 409 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  37.73 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 438 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.18 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.82 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 474 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.79 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 		 457 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 407 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.19 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  37.94 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  35.75 
 
 		 412 aa  226  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.81 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  39.28 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  37.07 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  35.48 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  35.42 
 
 		 408 aa  220  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.1 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  43.15 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.7 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  37.41 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  35.44 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.49 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  37 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.95 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.95 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  35.41 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  35.19 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.88 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 		 486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 		 438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.88 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  35.49 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  36.83 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 398 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.26 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.85 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.54 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  35.03 
 
 		 438 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.68 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  34.43 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.16 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 407 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.33 
 
 		 430 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  34.93 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  38.01 
 
 		 720 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  36.3 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  34 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.43 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  35.56 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>