More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1897 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  95.95 
 
 		 370 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  95.68 
 
 		 370 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  95.41 
 
 		 370 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 370 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  66.47 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  67.07 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  66.77 
 
 		 333 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  51.95 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  53.4 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  47.69 
 
 		 347 aa  328  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  44.07 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  47.68 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  46.89 
 
 		 329 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.33 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  48.77 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  42.68 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  43.56 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  43.73 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2182  putative transglycosylase  45.89 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00884137  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1631  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.77 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00716763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  40.32 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  40.32 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  34.03 
 
 		 409 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.66 
 
 		 454 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.68 
 
 		 436 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.02 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  32.03 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  33.73 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  31.62 
 
 		 424 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  30.95 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  35.69 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  31.34 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  31.62 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  34.98 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  35.35 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.77 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  28.9 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  32.43 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  31.83 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  31.83 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.92 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  30.25 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  30.98 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  30.26 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  30.28 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  33.76 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  33.12 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  34.08 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  34.29 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  31.58 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  30.72 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.97 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  31.77 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  30.47 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  33.01 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 438 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  32.17 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  31.49 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  31.96 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 418 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  32.44 
 
 		 445 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  32.48 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  32.11 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  32.93 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  34.01 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  31.33 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  30.41 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  30.87 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  33.12 
 
 		 429 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 435 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  30.9 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  32.2 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  31.65 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  31.39 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  31.31 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  32.24 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  29.28 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  32.24 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>