More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3675 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  67.6 
 
 		 283 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  62.08 
 
 		 271 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  52.17 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  50.38 
 
 		 272 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  53.56 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  50.37 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  52.72 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  52.08 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  50.21 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 412 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  48.02 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  49.17 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  40.6 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  44.26 
 
 		 412 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 458 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  42.54 
 
 		 275 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  43.77 
 
 		 442 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  48.4 
 
 		 434 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  42 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  43.33 
 
 		 462 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  42.44 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  44.4 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  41.98 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  41.42 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  41.42 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  46.35 
 
 		 394 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.28 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  44.5 
 
 		 455 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  40.89 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  46.89 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  37.79 
 
 		 381 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  43.09 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  42.79 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 		 405 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  40.98 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  40.98 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  42.74 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  41.94 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  42.61 
 
 		 401 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  44.76 
 
 		 415 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.23 
 
 		 424 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  44.02 
 
 		 421 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  38.94 
 
 		 409 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  43.54 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  40.85 
 
 		 445 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  40.85 
 
 		 445 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.15 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  43.06 
 
 		 417 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.75 
 
 		 470 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 440 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  43.06 
 
 		 419 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  42.23 
 
 		 438 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 362 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  42.99 
 
 		 418 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  43.96 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 430 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.52 
 
 		 415 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  43.35 
 
 		 434 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  39.27 
 
 		 448 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 395 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  40 
 
 		 372 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.53 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  39.51 
 
 		 412 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  41.41 
 
 		 413 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  42.79 
 
 		 474 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  35.56 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  40.78 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 418 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 377 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 427 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.79 
 
 		 392 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  44.08 
 
 		 514 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 413 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  40.43 
 
 		 422 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  36.52 
 
 		 324 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  40.19 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  31.09 
 
 		 436 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 438 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 438 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  36.4 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.8 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  31.17 
 
 		 438 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 474 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  39.81 
 
 		 432 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 428 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>