More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1404 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  92.76 
 
 
412 aa  713    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  100 
 
 
372 aa  759    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  59.29 
 
 
394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  54.32 
 
 
389 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  52.41 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  53.1 
 
 
396 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  50.67 
 
 
390 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  51.34 
 
 
398 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  54.63 
 
 
405 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  53.73 
 
 
405 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  48.51 
 
 
442 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  46.92 
 
 
434 aa  342  8e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  46.34 
 
 
462 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  45.53 
 
 
458 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  45.8 
 
 
412 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  45.65 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
417 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.81 
 
 
470 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.25 
 
 
401 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 
395 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 
410 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 
434 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 
457 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.07 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.6 
 
 
434 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
428 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 
409 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.84 
 
 
421 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.04 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 
396 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  37.6 
 
 
474 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 
377 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 
432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
430 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.23 
 
 
395 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.24 
 
 
433 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
439 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.51 
 
 
438 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  36.9 
 
 
445 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 
440 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  36.61 
 
 
400 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
411 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
438 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 
436 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 
415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.24 
 
 
445 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  36.02 
 
 
438 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37 
 
 
720 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  35.16 
 
 
438 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.98 
 
 
417 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 
438 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 
438 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  35.2 
 
 
427 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  36.44 
 
 
398 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  36.29 
 
 
448 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  33.7 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.85 
 
 
398 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  35.89 
 
 
421 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  34.22 
 
 
395 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 
422 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 
430 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.32 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 
427 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  36.13 
 
 
413 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.21 
 
 
411 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  34.42 
 
 
415 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  36.13 
 
 
413 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 
398 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 
398 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.21 
 
 
462 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 
413 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 
392 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  33.24 
 
 
398 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 
424 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  34.24 
 
 
438 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  36.46 
 
 
393 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 
393 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  31.88 
 
 
427 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 
400 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  33.51 
 
 
514 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  31.88 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  32.53 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  36.42 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  33.24 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  35.23 
 
 
418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  31.99 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 
429 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  32.39 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  34.24 
 
 
486 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  32.71 
 
 
443 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  33.96 
 
 
406 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 
430 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 
391 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>