More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0371 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
390 aa  792    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  69.09 
 
 
389 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  62.92 
 
 
398 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  54.84 
 
 
405 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  52.06 
 
 
396 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  51.49 
 
 
405 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  52.34 
 
 
394 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  51.76 
 
 
405 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  50.67 
 
 
372 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  50.54 
 
 
412 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 
442 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  43.88 
 
 
412 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  43.19 
 
 
458 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  42.24 
 
 
462 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  42.89 
 
 
434 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  41.32 
 
 
412 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 
434 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.54 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 
417 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 
428 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  33.97 
 
 
395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  34.65 
 
 
439 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.05 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.81 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  35.66 
 
 
395 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.22 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 
438 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.22 
 
 
411 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  33.7 
 
 
377 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.22 
 
 
436 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 
424 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 
409 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.51 
 
 
433 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  35.95 
 
 
438 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  35.95 
 
 
438 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  35.41 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.62 
 
 
401 aa  236  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
400 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 
438 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 
400 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.42 
 
 
421 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  34.24 
 
 
415 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 
470 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  35.77 
 
 
421 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 
393 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  32.88 
 
 
437 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  35.04 
 
 
454 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  35.15 
 
 
438 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.59 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  35.41 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  34.67 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  34.67 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  34.77 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 
424 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 
457 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  34.3 
 
 
448 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 
474 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 
466 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  34.32 
 
 
438 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  34.2 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.14 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  33.97 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  33.6 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  35.01 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.23 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  34.96 
 
 
398 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  34.85 
 
 
720 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  32.64 
 
 
398 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  34.55 
 
 
417 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 
432 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 
419 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 
398 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  32.28 
 
 
455 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 
398 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.33 
 
 
462 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 
413 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 
419 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 
430 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  33.06 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  35.23 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  34.77 
 
 
413 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  38.04 
 
 
391 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.06 
 
 
435 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  29.85 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  34.23 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  34.5 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  32.11 
 
 
398 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 
451 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  32.83 
 
 
412 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  31.27 
 
 
443 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  31.32 
 
 
415 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  33.96 
 
 
429 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  32.89 
 
 
418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  32.89 
 
 
464 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 
429 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>