More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4233 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  92.31 
 
 		 273 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  72.69 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  73.14 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  64.73 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  64.73 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  70.36 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  66.8 
 
 		 275 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  62.74 
 
 		 265 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  62.74 
 
 		 261 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  64.4 
 
 		 261 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  61.96 
 
 		 265 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  62.04 
 
 		 266 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  62.35 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  57.83 
 
 		 254 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  58.73 
 
 		 272 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  57.96 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  56.86 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  56.86 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  52.36 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  51.84 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  42.59 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  42.91 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  42.98 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  42.57 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  42.45 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  41.77 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  40.73 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 362 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 362 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  34.04 
 
 		 409 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  38.42 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  35.27 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  41.4 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 		 434 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  36.28 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 428 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 396 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 396 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  31.91 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  38.53 
 
 		 412 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 442 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 438 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  38.1 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  39.09 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  39.65 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.66 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.75 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 462 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  37.62 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.23 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  35.5 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  38.2 
 
 		 458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  36.71 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.78 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  34.23 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 434 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  38.03 
 
 		 405 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 429 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.32 
 
 		 421 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 430 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.8 
 
 		 417 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.91 
 
 		 415 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 419 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.74 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 470 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  35.04 
 
 		 427 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 432 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 398 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.16 
 
 		 421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.33 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  33.82 
 
 		 417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.41 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  33.74 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.43 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  32.88 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  33.03 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  33.03 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  37.38 
 
 		 438 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 424 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  33.66 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  32.88 
 
 		 436 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>