More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0825 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  89.47 
 
 		 267 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  89.47 
 
 		 267 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  65.57 
 
 		 270 aa  344  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  69.26 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  60 
 
 		 271 aa  311  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  58.78 
 
 		 275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  58.78 
 
 		 275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  57.14 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  58.44 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  57.96 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  56.97 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  58.23 
 
 		 273 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  56.85 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  57.38 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  54.92 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  54.32 
 
 		 316 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  56.97 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  56.97 
 
 		 265 aa  264  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  54.29 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  53.69 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  41.02 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  40.08 
 
 		 283 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  38.8 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  40.5 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  38.78 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  40.08 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  39.83 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 272 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 		 412 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  37.32 
 
 		 372 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 394 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  35.21 
 
 		 381 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.9 
 
 		 466 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  42.33 
 
 		 474 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  41.09 
 
 		 396 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 		 457 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 428 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  42.44 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 434 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 370 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  39.22 
 
 		 430 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.48 
 
 		 417 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  39.6 
 
 		 377 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 421 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.11 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.32 
 
 		 401 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.81 
 
 		 419 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.81 
 
 		 417 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  37.55 
 
 		 412 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.7 
 
 		 455 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 415 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 438 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  36.82 
 
 		 412 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 438 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.02 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  38.16 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  33.49 
 
 		 409 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 425 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 410 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 438 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 438 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  39.18 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  38.31 
 
 		 448 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 454 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.81 
 
 		 421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  35.11 
 
 		 405 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 		 438 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 438 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 438 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 436 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 434 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 417 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.15 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 398 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  42.78 
 
 		 411 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  36.62 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.08 
 
 		 433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  37.87 
 
 		 427 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 440 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 429 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.27 
 
 		 430 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  33.05 
 
 		 424 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  34.68 
 
 		 396 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 439 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.05 
 
 		 424 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 438 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  38.42 
 
 		 432 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 427 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>