More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1178 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  97.7 
 
 		 261 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  78.24 
 
 		 265 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  83.47 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  83.06 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  68.73 
 
 		 272 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  67.05 
 
 		 275 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  67.05 
 
 		 275 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  67.74 
 
 		 254 aa  344  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  66.28 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  62.74 
 
 		 290 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  68.18 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  62.07 
 
 		 273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  62.11 
 
 		 271 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  64.2 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  57.25 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  57.25 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  56.97 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  54.25 
 
 		 270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  53.46 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  43.89 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  44.02 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  40.75 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  37.75 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  39.84 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  38.65 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  39.83 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  39.15 
 
 		 396 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  34.42 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  34.42 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  34.42 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 		 390 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  37.62 
 
 		 412 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 396 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  39.09 
 
 		 394 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  37.08 
 
 		 442 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.34 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.3 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.83 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 412 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 419 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  38.74 
 
 		 395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  40.83 
 
 		 405 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 346 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  37.04 
 
 		 405 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  30.92 
 
 		 347 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 415 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 438 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  35.21 
 
 		 372 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 400 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  31.8 
 
 		 428 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  37.28 
 
 		 457 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  33.6 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 438 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 411 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 436 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  39.64 
 
 		 405 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 412 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 438 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 417 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 438 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 438 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  35.24 
 
 		 462 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  37.17 
 
 		 395 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 424 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 430 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 424 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  37.38 
 
 		 440 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 		 438 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.27 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.08 
 
 		 433 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 466 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 438 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 474 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  30.8 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 439 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 410 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 445 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  35.71 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 470 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  35.55 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  31.58 
 
 		 427 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  30.37 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  32.19 
 
 		 427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  30.22 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 		 415 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>