More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4395 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  58.43 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  62.59 
 
 		 271 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  57.14 
 
 		 272 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  55.14 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  55.56 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  55.69 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  55.74 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  51.67 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  52.67 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  53.39 
 
 		 412 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  53.24 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  47.24 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  50.22 
 
 		 442 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  48.18 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  50.23 
 
 		 462 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  46.01 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  46.01 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  50.68 
 
 		 458 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  45.38 
 
 		 275 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  45.21 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  42.22 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  42.68 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  46.38 
 
 		 438 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  46.6 
 
 		 438 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  46.6 
 
 		 438 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  46.6 
 
 		 438 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  43.84 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.18 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  45.49 
 
 		 396 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  46.93 
 
 		 394 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  41.7 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.85 
 
 		 393 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.43 
 
 		 417 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  43.81 
 
 		 445 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  43.81 
 
 		 445 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.51 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 		 421 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  44.02 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  45.41 
 
 		 401 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  44.19 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  40.25 
 
 		 455 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  46.83 
 
 		 434 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  40.51 
 
 		 395 aa  185  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  41.48 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  41.48 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 440 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  46.38 
 
 		 470 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  43 
 
 		 438 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  44.31 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  45.15 
 
 		 417 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 		 419 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  41.6 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  44.23 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  43.46 
 
 		 424 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.02 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 454 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  45.89 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 381 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  42.08 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  45.63 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  45.89 
 
 		 418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 477 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  39.92 
 
 		 448 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.78 
 
 		 377 aa  178  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  44.66 
 
 		 474 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.96 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  41.41 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  41.87 
 
 		 412 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  37.09 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  42.28 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  35.86 
 
 		 389 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 438 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.57 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 434 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 404 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  45.67 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  41.12 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  40.78 
 
 		 427 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  47.39 
 
 		 405 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 428 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  41.7 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  42.31 
 
 		 320 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.08 
 
 		 396 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  46.45 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39 
 
 		 398 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  43.93 
 
 		 396 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  36.25 
 
 		 415 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.11 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  42.18 
 
 		 720 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>