More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0836 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  89.47 
 
 		 247 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  63.64 
 
 		 270 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  64.39 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  59.92 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  57.63 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  57.63 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  56.87 
 
 		 275 aa  304  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  54.24 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  56.86 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  58.61 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  58.92 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  56.79 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  57.25 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  57.25 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  53.85 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  59.02 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  56.18 
 
 		 264 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  54.32 
 
 		 316 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  54.92 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  40.84 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  41.04 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  41.48 
 
 		 271 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  39.03 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  40.07 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  39.83 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  39.67 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  39.23 
 
 		 412 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  38.28 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 394 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  35.63 
 
 		 381 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 474 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.01 
 
 		 466 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 		 417 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 370 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  42.63 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 457 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 421 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  40.78 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  40.78 
 
 		 419 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  39.82 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.6 
 
 		 455 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 428 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40.51 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 362 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 362 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  34.62 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  36.8 
 
 		 390 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 346 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  38.97 
 
 		 395 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  36.64 
 
 		 395 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  35.24 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 430 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  36.16 
 
 		 398 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 470 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.87 
 
 		 421 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  36.82 
 
 		 448 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 412 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.85 
 
 		 415 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  32.73 
 
 		 409 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 438 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 425 aa  131  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 410 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 438 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 438 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 411 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 436 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 434 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 438 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  37.63 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  33.77 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 432 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  32.34 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.82 
 
 		 448 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  34.76 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 454 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.91 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.76 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 438 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.18 
 
 		 433 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.18 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  36.87 
 
 		 395 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.02 
 
 		 430 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 437 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  38.24 
 
 		 427 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  33.79 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  39.77 
 
 		 438 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  38.01 
 
 		 429 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  37.64 
 
 		 405 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>