More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3343 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  70.36 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  67.53 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  68.55 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  68.55 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  69.01 
 
 		 273 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  66.94 
 
 		 275 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  64.61 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  65.43 
 
 		 266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  61.69 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  59.92 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  59.92 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  60 
 
 		 247 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  63.71 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  62.11 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  62.11 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  62.04 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  59.2 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  56.72 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  55.13 
 
 		 270 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  55.02 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  47.89 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  45.21 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  48.89 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  44.86 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  44.86 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  45.27 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  43.62 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  43.17 
 
 		 412 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 434 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  40.53 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.48 
 
 		 401 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 438 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  39.91 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  40.09 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  37.65 
 
 		 390 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 442 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  39.27 
 
 		 389 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 438 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.78 
 
 		 396 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  39.06 
 
 		 377 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.5 
 
 		 428 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  34.86 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 362 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 362 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 448 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  32.88 
 
 		 361 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 		 434 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.82 
 
 		 409 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  37.13 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 396 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 438 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.94 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.32 
 
 		 424 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  32.89 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.32 
 
 		 430 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.32 
 
 		 424 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  34.88 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.85 
 
 		 448 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 474 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 440 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.65 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.65 
 
 		 466 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.87 
 
 		 439 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  32.71 
 
 		 436 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  34.33 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  32.24 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.9 
 
 		 421 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.87 
 
 		 433 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  33.5 
 
 		 412 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  32.24 
 
 		 411 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  32.24 
 
 		 438 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  32.61 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 454 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  37.38 
 
 		 445 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  39.42 
 
 		 421 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  33.82 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.42 
 
 		 419 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.83 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  36.98 
 
 		 415 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 405 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.19 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.94 
 
 		 417 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  36.32 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  36.41 
 
 		 445 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 470 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  33.72 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.21 
 
 		 455 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.02 
 
 		 395 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>