More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3366 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 283 aa  583  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  67.6 
 
 		 271 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  58.43 
 
 		 271 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  54.58 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  53.11 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  52.92 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  52.08 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  50.98 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  50.83 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  50.83 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  47.55 
 
 		 434 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  47.88 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  40.89 
 
 		 412 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  47.48 
 
 		 412 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  46.12 
 
 		 462 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  47.21 
 
 		 458 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  47.89 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  47.28 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  42.11 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  43.68 
 
 		 275 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  42.53 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  42.53 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  43.28 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  43.89 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  43.89 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  44.8 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  43.24 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  43.62 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 405 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  40.3 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  37.65 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  44.71 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 409 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  44.71 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  40.84 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  40.84 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.37 
 
 		 455 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  42.34 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 		 438 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.2 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  42.79 
 
 		 421 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 		 438 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 		 438 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  42.38 
 
 		 415 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.21 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  42.42 
 
 		 438 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  30.03 
 
 		 411 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.08 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  43.26 
 
 		 457 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 466 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  43.69 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  40.26 
 
 		 491 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.91 
 
 		 440 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  44.13 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  41.75 
 
 		 445 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  30.12 
 
 		 438 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.93 
 
 		 434 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  41.75 
 
 		 445 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 412 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  43.48 
 
 		 474 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.95 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  30.07 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  29.67 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  39.81 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36.49 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  36.49 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36.49 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  39.33 
 
 		 490 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 438 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 438 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  36.89 
 
 		 323 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.5 
 
 		 448 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  29.53 
 
 		 439 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 454 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  33.79 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  39.77 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 422 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  37.45 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.96 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.4 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  39.81 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  38.35 
 
 		 395 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.42 
 
 		 415 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>