More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6390 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  72.61 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  71.01 
 
 		 264 aa  352  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  67.34 
 
 		 272 aa  347  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  68.49 
 
 		 266 aa  345  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  68.88 
 
 		 261 aa  337  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  67.74 
 
 		 261 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  67.74 
 
 		 265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  61.57 
 
 		 275 aa  321  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  61.57 
 
 		 275 aa  321  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  60.39 
 
 		 275 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  57.83 
 
 		 290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  57.43 
 
 		 273 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  59.2 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  58.4 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  54.32 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  54.92 
 
 		 267 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  54.92 
 
 		 267 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  53.25 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  53.69 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  52.36 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  44.4 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  41.6 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  41.53 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  40.73 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  39.52 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  36.55 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 361 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36.74 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  36.62 
 
 		 346 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 		 417 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  34.43 
 
 		 372 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  38.11 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 419 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.83 
 
 		 417 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  35.35 
 
 		 412 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 394 aa  131  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 455 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 417 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 438 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.29 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 438 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.25 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 370 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  34.16 
 
 		 390 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 438 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  37.07 
 
 		 434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  40.58 
 
 		 415 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  40.2 
 
 		 442 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.72 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 434 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  35.91 
 
 		 389 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  32.88 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 457 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 466 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 474 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  33.94 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  35.66 
 
 		 458 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  37.95 
 
 		 396 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.67 
 
 		 448 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.89 
 
 		 432 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  38.21 
 
 		 448 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 462 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 438 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  34.8 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 396 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 440 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 428 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.63 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 395 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.44 
 
 		 445 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35 
 
 		 395 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 438 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.95 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 454 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  36.62 
 
 		 470 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 		 411 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 		 438 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 		 438 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 349 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  33.94 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  33.5 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 439 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  35.22 
 
 		 434 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>