More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0431 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0431  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0845206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2079  hypothetical protein  83.71 
 
 		 266 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1049  hypothetical protein  77.36 
 
 		 265 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.916678  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1178  hypothetical protein  78.24 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0994  hypothetical protein  82.57 
 
 		 261 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0346  hypothetical protein  77.64 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.704428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3674  hypothetical protein  68.3 
 
 		 272 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0658375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6390  putative lytic murein transglycosylase  72.61 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  62.08 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  62.08 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  63.86 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3343  lytic murein transglycosylase  61.69 
 
 		 271 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4233  lytic murein transglycosylase  61.96 
 
 		 290 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  61.81 
 
 		 273 aa  314  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  64.44 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  60.08 
 
 		 316 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  58.61 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  58.61 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  56.97 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  50.59 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  51.81 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  43.24 
 
 		 283 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  41.7 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  40.23 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  40.96 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  40.95 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  40.08 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.82 
 
 		 434 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 412 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  37.07 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  32.56 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  32.56 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  32.56 
 
 		 361 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 417 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  37.38 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  38.42 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 415 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.07 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 457 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  35.34 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 438 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 412 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.35 
 
 		 417 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.65 
 
 		 396 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  33.87 
 
 		 434 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 		 421 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 438 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.62 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.01 
 
 		 417 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  34.18 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  34.73 
 
 		 442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  39.05 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  37.38 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 		 438 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 		 438 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 		 411 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 428 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  32.19 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 400 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  32.88 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  37.02 
 
 		 474 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  34.54 
 
 		 458 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.04 
 
 		 433 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 466 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.05 
 
 		 421 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 405 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  33.48 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  35.36 
 
 		 462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  37.28 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 470 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.06 
 
 		 395 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  35.6 
 
 		 395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 440 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  32 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 438 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  40.41 
 
 		 411 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  30.33 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  29.41 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  35 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  28.64 
 
 		 323 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.05 
 
 		 392 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  29.33 
 
 		 409 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>