More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2682 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 423 aa  853    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  55.68 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.05 
 
 		 416 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.13 
 
 		 351 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.89 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  39.05 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  39.05 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  32.73 
 
 		 268 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  37.8 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  37.8 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  37.2 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  36.14 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  35.54 
 
 		 361 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  27.3 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  26.97 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  34.9 
 
 		 371 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  32.76 
 
 		 361 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  31.61 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  26.97 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  32.76 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  31.61 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  26.64 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  26.97 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 364 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  34.23 
 
 		 367 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  35.95 
 
 		 365 aa  87.4  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  29.38 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  33 
 
 		 356 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  30.26 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  29.27 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  30.77 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  29.95 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  31.15 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  31.16 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  30.51 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  34.94 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  29.91 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  34.94 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  28.87 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  30.51 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  31.03 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  31.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  31.53 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  31.61 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  30 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  29.41 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  29.41 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  32.32 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  28.65 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  28.08 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  28.37 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  28.08 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  28.65 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0509  lytic murein transglycosylase B  32.56 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  28.65 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  35.29 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  32.8 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  32.29 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0984  lytic murein transglycosylase  30.35 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  28.12 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  28 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  33.91 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  28.5 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  33.74 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1294  lytic murein transglycosylase B  32.16 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  34.67 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  27.36 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.07 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  30.29 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1493  lytic murein transglycosylase  29 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  35.15 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  36.36 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  34.64 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  36.18 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3965  lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  36.36 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2862  lytic murein transglycosylase  30.54 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  31.94 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1019  hypothetical protein  25.49 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4119  lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  33.99 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  35.58 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  36.84 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1469  peptidoglycan N-acetylmuramoylhydrolase  32.24 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143002  normal  0.474998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>