More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0389 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.63 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.63 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40.48 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.25 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  37.11 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  40.3 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.95 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  34.43 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  32.96 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 419 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  35.03 
 
 		 373 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  34.09 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.71 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  35.44 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  32.4 
 
 		 363 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  36.08 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  27.95 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  31.84 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  31.84 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  35.44 
 
 		 366 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  27.95 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  31.9 
 
 		 372 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  29.6 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  28.35 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  34.27 
 
 		 374 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 466 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  37.18 
 
 		 367 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  32.14 
 
 		 470 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  28.2 
 
 		 336 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1294  lytic murein transglycosylase B  32.43 
 
 		 417 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  30.49 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  30.49 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  32.58 
 
 		 341 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  33.9 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  33.71 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  30.63 
 
 		 405 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  36.54 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  27.24 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  33.52 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2937  lytic murein transglycosylase B  33.9 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000220956  normal  0.0240906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  27.63 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  29.41 
 
 		 457 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.15 
 
 		 372 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  33.89 
 
 		 361 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 444 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0697  lytic murein transglycosylase B  32.22 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0681454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  31.84 
 
 		 356 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  29.11 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  29.61 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0509  lytic murein transglycosylase B  33.51 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  28.37 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  29.5 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  33.33 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  35.26 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  27.15 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  35.26 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1515  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.83 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  35.26 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  32.2 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  37.01 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  29.84 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1469  peptidoglycan N-acetylmuramoylhydrolase  32.94 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143002  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3909  lytic murein transglycosylase  25.27 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813736  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  34.78 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1269  lytic murein transglycosylase B  36.31 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  28.46 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  31.79 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2634  lytic murein transglycosylase B  32.95 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  30.17 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  32.4 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0662  lytic murein transglycosylase B  28.38 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0105641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  29.94 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  30.17 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  30.17 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  32.95 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  28.91 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  27.23 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  25.66 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  27.23 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  30.51 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  33.15 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4364  hypothetical protein  26.58 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>