More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1382 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1382  MltB  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.11 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.75 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.75 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.27 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  32.06 
 
 		 349 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.09 
 
 		 423 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.72 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  32.09 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  32.09 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  33.49 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  33.97 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  31.37 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  31.37 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  32.35 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  31.37 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  31.37 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  36.22 
 
 		 330 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  35.93 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.18 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  36.14 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  32.62 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.18 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  33.17 
 
 		 405 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  35.67 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  41.22 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  38.46 
 
 		 340 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  33.01 
 
 		 444 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  37.27 
 
 		 336 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  36.65 
 
 		 348 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  32.68 
 
 		 405 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  36.65 
 
 		 336 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  32.68 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  35.67 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  35.58 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  36.65 
 
 		 336 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  37.82 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  36.08 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  30.05 
 
 		 359 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  30.05 
 
 		 359 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  31.86 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  37.18 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 		 400 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  29.58 
 
 		 359 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  37.5 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  30.41 
 
 		 354 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  32.35 
 
 		 354 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  30.7 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  32.68 
 
 		 456 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  30.7 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  30.7 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  30.7 
 
 		 361 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  30.7 
 
 		 361 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  29.58 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 370 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  32.35 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2937  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 335 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000220956  normal  0.0240906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  30.23 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  30.23 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  35.29 
 
 		 357 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  32.35 
 
 		 354 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  31.48 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  35.78 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  35.29 
 
 		 357 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  30.23 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  34.58 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 395 aa  90.1  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  29.58 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  34.57 
 
 		 366 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  31.86 
 
 		 354 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  29.77 
 
 		 361 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  36.47 
 
 		 390 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  35.06 
 
 		 474 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  35.06 
 
 		 458 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  31.48 
 
 		 356 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  35.06 
 
 		 431 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  35.06 
 
 		 431 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  35.06 
 
 		 431 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  35.06 
 
 		 452 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  36.59 
 
 		 363 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  35.06 
 
 		 433 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  35.44 
 
 		 356 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.48 
 
 		 372 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  31.71 
 
 		 406 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  31.71 
 
 		 448 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2634  lytic murein transglycosylase B  29.96 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  36.88 
 
 		 392 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  31.02 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1835  hypothetical protein  36.08 
 
 		 338 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  30 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2709  lytic murein transglycosylase B  32.69 
 
 		 344 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1838  hypothetical protein  36.08 
 
 		 338 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  29.52 
 
 		 374 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  32.6 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2556  lytic murein transglycosylase B  28.57 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  28.78 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  32.35 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0991  putative murein transglycosylase  31.12 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2992  lytic murein transglycosylase B  31.63 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106271  hitchhiker  0.00132596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  28.78 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>