More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2556 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2556  lytic murein transglycosylase B  100 
 
 		 368 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  85.87 
 
 		 408 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  68.12 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  67.3 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  70.21 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  64.42 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  63.5 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  64.72 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  64.72 
 
 		 448 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  59.72 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  63.8 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  64.11 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  63.19 
 
 		 433 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  63.19 
 
 		 474 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  63.19 
 
 		 431 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  63.19 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  62.88 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  63.19 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  63.19 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2992  lytic murein transglycosylase B  57.26 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106271  hitchhiker  0.00132596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  64.26 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0755  lytic murein transglycosylase B  59.94 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0991  putative murein transglycosylase  55.97 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  46.69 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0509  lytic murein transglycosylase B  41.02 
 
 		 422 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  47 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  44.68 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  43.64 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1294  lytic murein transglycosylase B  43.22 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  40.66 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  41.67 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  42.99 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  42.99 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  43.61 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  42.86 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  40.61 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  43.32 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  40.96 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  42.51 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  41.87 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  40.43 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  42.15 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.96 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  40.56 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  40.91 
 
 		 336 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.66 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  41.96 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  42.86 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1269  lytic murein transglycosylase B  37.77 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.282145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  41.23 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  40.49 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  40.85 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  40.85 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  40.49 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  40.55 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.85 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  40.31 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  40.85 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  40.85 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  40.49 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  42.02 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  40.49 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  40.55 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  40 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  39.7 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  38.02 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  40.18 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  41.23 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  42.33 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  40.34 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  40.98 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2634  lytic murein transglycosylase B  39.23 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  38.42 
 
 		 330 aa  213  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  39.38 
 
 		 371 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  40.3 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  40.37 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  40.25 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  35.03 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  38.03 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0697  lytic murein transglycosylase B  35.24 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0681454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  37.7 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  37.38 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  38.41 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  38.13 
 
 		 329 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  37.38 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  38.93 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2709  lytic murein transglycosylase B  40.75 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  39.22 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  36.31 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  36.07 
 
 		 354 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  35.93 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  36.07 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1835  hypothetical protein  35.22 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  35.74 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  36.27 
 
 		 344 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1838  hypothetical protein  35.22 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  37.01 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  39.26 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  32.97 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3487  lytic murein transglycosylase B  38.08 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  hitchhiker  0.0000000197037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>