More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3035 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  100 
 
 		 336 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  100 
 
 		 336 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.87 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.81 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.05 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  36.7 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  37.62 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.18 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  36.5 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  32.42 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  36.52 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  32.42 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  33.78 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  36.16 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  36.16 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  30.6 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  30.6 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  30.6 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  32.4 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  31.43 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0755  lytic murein transglycosylase B  33.86 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  31.46 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  32.58 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  31.43 
 
 		 383 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1385  membrane-bound lytic transglycosylase  32.58 
 
 		 370 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0841166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  31.46 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  34.22 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1315  lytic murein transglycosylase B  32.58 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.213474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  31.15 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  31.15 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  29.18 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  28.36 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  30.9 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  31.46 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  30.9 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.25 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  28.36 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  28.21 
 
 		 401 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  29.95 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  24.92 
 
 		 271 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  34.29 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  33.33 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  35.91 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  32.77 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  28.23 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  35.71 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.25 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  30.11 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  30.56 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  35.71 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  27.99 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2709  lytic murein transglycosylase B  33.64 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  30.11 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  30.11 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  34.86 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  34.62 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  35.36 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  31.54 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  35.36 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  34.07 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  34.62 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  33.16 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  35.91 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  32.62 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04282  lytic murein transglycosylase B  32.2 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  32.62 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  31.6 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  29.57 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  33.15 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  35.91 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  26.33 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3710  lytic murein transglycosylase B  34.08 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000626578  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  31.36 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.33 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  33.68 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.18 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  29.57 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  32.39 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  34.44 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  29.12 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  30.81 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  29.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  29.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  26.3 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  31.02 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  32.99 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  29.38 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  26.56 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>