More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3065 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  100 
 
 		 351 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.13 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.88 
 
 		 416 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  43.84 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.48 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.81 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.81 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  33.22 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  30.64 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  29.66 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  30.51 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  30.51 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  31.82 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  28.1 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  31.56 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  31.56 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  31.56 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  31.56 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  31.56 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  31.56 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  31.56 
 
 		 474 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  30.66 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  30.21 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  30.19 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  30.21 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  32 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  30.26 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  29.89 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  30.86 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0755  lytic murein transglycosylase B  27.7 
 
 		 462 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  30.86 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  29.71 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  30.86 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.19 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  27.46 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  30.23 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  28.26 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  30.34 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2992  lytic murein transglycosylase B  27.3 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106271  hitchhiker  0.00132596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0991  putative murein transglycosylase  31.76 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  29.14 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  29.21 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  29.14 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  29.14 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  29.21 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  30.11 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  27.83 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  28.74 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  28.74 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  28.57 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  28.74 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  29.21 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  29.21 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  28.09 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  28.09 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  28.57 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.09 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  29.46 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.09 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  28.57 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  31.84 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  26.73 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  28.41 
 
 		 392 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  27.84 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  28.76 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  24.89 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  30.3 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  27.32 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  30.3 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  28.33 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  29.19 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  26.42 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  30.29 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2937  lytic murein transglycosylase B  26.26 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000220956  normal  0.0240906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  26.97 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  28.07 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1385  membrane-bound lytic transglycosylase  30.11 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0841166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  27.59 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1315  lytic murein transglycosylase B  30.11 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.213474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  28.65 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  30.06 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  26.18 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  26.97 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  29.81 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  28.12 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2556  lytic murein transglycosylase B  25.24 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04282  lytic murein transglycosylase B  29.89 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  27.84 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  28.23 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1075  lytic murein transglycosylase  30 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.21 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  28.85 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  27.94 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  25.74 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>