More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6778 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  100 
 
 		 429 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  58.23 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  58.12 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  58.62 
 
 		 308 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  62.28 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  48.57 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  44.06 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 		 906 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  52.76 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  50.96 
 
 		 290 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  42.07 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.19 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  39.87 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  39.87 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  39.87 
 
 		 559 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  41.84 
 
 		 302 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  44.19 
 
 		 844 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.86 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  47.96 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.03 
 
 		 355 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.02 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  34.09 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  44.04 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  36.55 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  34.09 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  34.09 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  34.23 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  40.35 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.83 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  40.71 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  35.57 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  33.73 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  34.88 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.52 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.55 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  32.75 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  33.77 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  32.12 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.93 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.93 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.13 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  35.61 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  29.32 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.33 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.94 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  32.11 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  30.29 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  25.53 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  30.46 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.57 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  31.17 
 
 		 249 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  32.39 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  33.1 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.93 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  51.43 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.79 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  32.39 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  31.82 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  31.82 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  31.82 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.88 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  34.46 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  44.59 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  29.89 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  32.34 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.5 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.5 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  32.34 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  38.54 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.91 
 
 		 815 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  30.51 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  55.1 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  31.82 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.01 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.77 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  53.06 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  60.87 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  32.65 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  49.09 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  60.87 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  46.43 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>