73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4376 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  81.75 
 
 		 253 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  67.66 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  67.66 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  67.29 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  45.31 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  45.53 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.91 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  38.93 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 906 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.04 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  41.18 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  41.51 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.83 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  38.02 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  31.94 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.66 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  36.94 
 
 		 844 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.37 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  33.1 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  30.43 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  33.12 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  33.12 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  33.12 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  42.67 
 
 		 453 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  26.88 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.67 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  38.89 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 		 439 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.84 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  32.47 
 
 		 411 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  30.32 
 
 		 447 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  43.94 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  24.82 
 
 		 1048 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.11 
 
 		 662 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.96 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  30.07 
 
 		 541 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  30 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.3 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.76 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.21 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.21 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  30.13 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.23 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  29.37 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.85 
 
 		 506 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  32.11 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  39.22 
 
 		 682 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  29.91 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  29.05 
 
 		 425 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.34 
 
 		 196 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>