84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3431 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1114    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  98.93 
 
 
559 aa  1106    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  98.93 
 
 
559 aa  1106    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  67.59 
 
 
253 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  69.57 
 
 
313 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  64.85 
 
 
258 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  63.81 
 
 
220 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  48.84 
 
 
283 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  52.94 
 
 
264 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  52.45 
 
 
264 aa  240  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  52.45 
 
 
264 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  46.82 
 
 
281 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  53.33 
 
 
266 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  52.38 
 
 
301 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  48.91 
 
 
278 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.7 
 
 
355 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  40.32 
 
 
331 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  46.25 
 
 
334 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  50.98 
 
 
266 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  50.49 
 
 
266 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  50.49 
 
 
266 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  47.78 
 
 
275 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  36.71 
 
 
352 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  45.53 
 
 
429 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
906 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 
366 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  31.28 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.73 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  41.27 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
362 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.97 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.12 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.23 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 
384 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  35.66 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  25.48 
 
 
310 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  28.07 
 
 
272 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  25.48 
 
 
310 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  38.41 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  25.13 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.11 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  39.64 
 
 
844 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  32.56 
 
 
327 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  32.1 
 
 
443 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  32.1 
 
 
443 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  33.33 
 
 
302 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  32.1 
 
 
443 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.57 
 
 
362 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
381 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  26.38 
 
 
277 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.92 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  34.87 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.21 
 
 
377 aa  54.7  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 
233 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  25.43 
 
 
1048 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  45.07 
 
 
453 aa  50.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.86 
 
 
541 aa  50.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  23.96 
 
 
312 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.98 
 
 
314 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.33 
 
 
298 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.07 
 
 
506 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.89 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.66 
 
 
289 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.66 
 
 
662 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.23 
 
 
251 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  30.07 
 
 
390 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  34.29 
 
 
174 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  37.5 
 
 
1569 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  38.27 
 
 
242 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  38.27 
 
 
242 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 
241 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
300 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  36.59 
 
 
249 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.77 
 
 
251 aa  43.5  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>