94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0362 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 425 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  72.6 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  52.15 
 
 		 282 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  50 
 
 		 252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  50 
 
 		 252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  50 
 
 		 252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.27 
 
 		 277 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.57 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  43.5 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  52.91 
 
 		 289 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.29 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.96 
 
 		 275 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  55.1 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  43.3 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  43.3 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  45.69 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  49.1 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  46.28 
 
 		 242 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.13 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  40.39 
 
 		 249 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.4 
 
 		 242 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  44.06 
 
 		 212 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  49.38 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  48.11 
 
 		 243 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.88 
 
 		 251 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.18 
 
 		 267 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.53 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.81 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.02 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.93 
 
 		 662 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  50.69 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.77 
 
 		 249 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.79 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  39.88 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  42.94 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  40.24 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  41.57 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  41.57 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  41.57 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  44.97 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  36.78 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  34.87 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 378 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  34.27 
 
 		 844 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  27.22 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.44 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  29.61 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  32.62 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  33.33 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 327 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.56 
 
 		 354 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  25.7 
 
 		 352 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  33.54 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  29.23 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  27.56 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  31.94 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.01 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.72 
 
 		 355 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.46 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  25.95 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  37.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 		 176 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  29.14 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  29.01 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  29.32 
 
 		 720 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  28.45 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  25.6 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  29.01 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  28.72 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  29.37 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  38.98 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  28 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  31.3 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  39.13 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  36.71 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  41.94 
 
 		 175 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 362 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  48.78 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  38.04 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  48.78 
 
 		 333 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  27.17 
 
 		 271 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  27.13 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  29.29 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  29.29 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>