119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4241 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  72.18 
 
 
249 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  74.6 
 
 
249 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  69.3 
 
 
242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  69.3 
 
 
242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  67.81 
 
 
242 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  71.97 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  70.28 
 
 
212 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  70.72 
 
 
242 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  58.17 
 
 
252 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  52.49 
 
 
241 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  54.7 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.05 
 
 
425 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.34 
 
 
421 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.07 
 
 
815 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.86 
 
 
314 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  49.41 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.38 
 
 
289 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  54.4 
 
 
267 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.23 
 
 
275 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.3 
 
 
662 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  51.69 
 
 
251 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.5 
 
 
506 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  49.42 
 
 
466 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.13 
 
 
434 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  48.84 
 
 
377 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  50 
 
 
298 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  50.88 
 
 
453 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.31 
 
 
275 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  50.88 
 
 
216 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.07 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.91 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.65 
 
 
417 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  40.7 
 
 
443 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  40.7 
 
 
443 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  40.7 
 
 
443 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  43.27 
 
 
411 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
439 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  47.59 
 
 
546 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 
447 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.96 
 
 
378 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
411 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  49.35 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  34.5 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  34.71 
 
 
844 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  31.43 
 
 
429 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.36 
 
 
308 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  30.18 
 
 
349 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  43.66 
 
 
906 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  31.95 
 
 
390 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  43.04 
 
 
346 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  25.37 
 
 
433 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  39.51 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 
387 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  32.74 
 
 
427 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.76 
 
 
354 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.91 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  33.33 
 
 
175 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  35.53 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  40.85 
 
 
352 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.65 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.16 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 
267 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  30.92 
 
 
454 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 
267 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.73 
 
 
434 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  32.76 
 
 
434 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 
430 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  43.33 
 
 
445 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  54.35 
 
 
327 aa  45.4  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  29.69 
 
 
398 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  30.2 
 
 
392 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  31.09 
 
 
395 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  33.73 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  32.62 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  30.08 
 
 
398 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  49.12 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  34.74 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 
411 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 
438 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 
438 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 
436 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.89 
 
 
423 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.73 
 
 
415 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  32.2 
 
 
470 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  29.33 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  28.79 
 
 
440 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  33.9 
 
 
682 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  29.71 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  27.59 
 
 
308 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>