150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3191 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  63.79 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  51.9 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  53.15 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  53.15 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  55.07 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  51.44 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  48.13 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  48.13 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  48.13 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  53.89 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  49.79 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  51.32 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  46.76 
 
 		 282 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  48.24 
 
 		 289 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.5 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.66 
 
 		 421 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.39 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.32 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.79 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.58 
 
 		 466 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.86 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.09 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  36.97 
 
 		 389 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.63 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.51 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.83 
 
 		 506 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.38 
 
 		 377 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  36.63 
 
 		 443 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  36.63 
 
 		 443 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  36.63 
 
 		 443 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 447 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  40.1 
 
 		 411 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.69 
 
 		 815 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.72 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.35 
 
 		 417 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  44.9 
 
 		 546 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  40.2 
 
 		 453 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.53 
 
 		 662 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.4 
 
 		 378 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  40.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  40.12 
 
 		 423 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 411 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  31.61 
 
 		 844 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  30.29 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  46.88 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 400 aa  62  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  34.53 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 		 906 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  29.75 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  29.75 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  40.48 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  28.5 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  28 
 
 		 433 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  32.09 
 
 		 424 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  28 
 
 		 434 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 176 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  33.33 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  24.23 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  36.19 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  29.79 
 
 		 413 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.79 
 
 		 462 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  27.5 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  30.47 
 
 		 427 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 364 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.24 
 
 		 390 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  33.1 
 
 		 470 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  33.82 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 451 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  29.33 
 
 		 445 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  27.66 
 
 		 383 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  40.35 
 
 		 682 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  29.33 
 
 		 445 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.88 
 
 		 363 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  27.27 
 
 		 541 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  30.06 
 
 		 440 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  41.07 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  29.21 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  33.93 
 
 		 175 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  30.97 
 
 		 366 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  27.54 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  25.14 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  31.13 
 
 		 469 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 430 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  29.91 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  38.75 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  28.29 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  25.97 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  31.08 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>