85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1251 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1002    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  48.56 
 
 		 389 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  54.1 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  45.69 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.3 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.4 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  52.41 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  53.1 
 
 		 275 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  51.92 
 
 		 314 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.31 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  53.47 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  50.3 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.1 
 
 		 815 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  51.95 
 
 		 249 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  53.06 
 
 		 275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.93 
 
 		 252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.04 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.5 
 
 		 425 aa  140  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.5 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  50.29 
 
 		 216 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.79 
 
 		 662 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  46.43 
 
 		 252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  46.43 
 
 		 252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  46.43 
 
 		 252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  46.84 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  47.49 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  43.45 
 
 		 241 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  51.68 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  42.35 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  42.35 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  42.35 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  44.44 
 
 		 411 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  37.64 
 
 		 249 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  43.87 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  42.51 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  42.51 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  43.11 
 
 		 242 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50 
 
 		 277 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  37.26 
 
 		 249 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  43.26 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  41.92 
 
 		 242 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  41.92 
 
 		 212 aa  104  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  45.2 
 
 		 243 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 378 aa  90.5  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  36.02 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 366 aa  87.4  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  37.08 
 
 		 844 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  35 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  54.05 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 906 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  31.17 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  32.6 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  41.96 
 
 		 352 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  32.91 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  42.35 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.24 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  55.29 
 
 		 719 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  45.08 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  32.67 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  41.03 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.67 
 
 		 2449 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.21 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  36.44 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.74 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.34 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  31.69 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  41.03 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  27.59 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  34.75 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  31.69 
 
 		 1013 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.33 
 
 		 378 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  36.76 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  33.57 
 
 		 975 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  38.89 
 
 		 982 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  36.96 
 
 		 324 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 362 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>