121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1569 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  68.37 
 
 		 241 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  57.21 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  57.21 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  58.55 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  58.55 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  52.94 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  58.55 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  57.21 
 
 		 212 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  48.78 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  57.22 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  53.73 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  58.95 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  45.76 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.62 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  53.14 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.18 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.57 
 
 		 425 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.34 
 
 		 421 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  49.7 
 
 		 466 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  47.67 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.55 
 
 		 277 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.4 
 
 		 815 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.81 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  49.71 
 
 		 377 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.31 
 
 		 298 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.62 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  53.85 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.51 
 
 		 506 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  48.13 
 
 		 453 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  50.29 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.83 
 
 		 434 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  46.11 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.37 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.05 
 
 		 662 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  38.31 
 
 		 443 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  38.31 
 
 		 443 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  38.31 
 
 		 443 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  49.32 
 
 		 546 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  40.69 
 
 		 439 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  40.2 
 
 		 447 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  40.3 
 
 		 411 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  43.33 
 
 		 423 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.51 
 
 		 378 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.13 
 
 		 429 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 366 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  33.71 
 
 		 844 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  35.82 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  46.67 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  31.29 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  30.18 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  43.21 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  31.65 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  41.25 
 
 		 346 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  36.36 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  38.75 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  30.95 
 
 		 362 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  29.92 
 
 		 433 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 176 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  44.3 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  29.63 
 
 		 434 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  30.6 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  33.96 
 
 		 430 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  29.05 
 
 		 372 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.27 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.13 
 
 		 434 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  38 
 
 		 682 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  30 
 
 		 308 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  26.95 
 
 		 381 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  38.24 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  29.82 
 
 		 410 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  31.82 
 
 		 327 aa  45.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  29.33 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  29.6 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  28.57 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  37.04 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  34.57 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  32.46 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  26.57 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  52.38 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.78 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.71 
 
 		 541 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  28 
 
 		 445 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  35.29 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  35.29 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  31.45 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  31.58 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  27.06 
 
 		 438 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  27.06 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  32.33 
 
 		 720 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  28.06 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  27.61 
 
 		 395 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  28.85 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  28.67 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  28.06 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>