75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0669 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  62.3 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.26 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  53.76 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  51.6 
 
 		 252 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  48.42 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  53.04 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  51.1 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  51.1 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  51.1 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.73 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.65 
 
 		 425 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.96 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.5 
 
 		 506 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.2 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.7 
 
 		 434 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  48.5 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  45.95 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  44.94 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  44.94 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  45.56 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.73 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  45.41 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  44.94 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  39.27 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  51.28 
 
 		 546 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  46.37 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.11 
 
 		 662 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.92 
 
 		 815 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.26 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  43.82 
 
 		 212 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.64 
 
 		 267 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  45.03 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  47.7 
 
 		 453 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.75 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  37.4 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  37.4 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  37.4 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  45.14 
 
 		 216 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  42.69 
 
 		 411 aa  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.32 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  42.67 
 
 		 423 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  37.99 
 
 		 411 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  34.73 
 
 		 844 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  41.33 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  30.2 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  33.1 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  32.3 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  27.94 
 
 		 417 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 906 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  43.21 
 
 		 559 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  43.21 
 
 		 559 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.39 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  26.52 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  38.53 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  28.82 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  37.61 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  41.98 
 
 		 559 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  27.59 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  26.92 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.29 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  39.47 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  29.66 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.45 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.94 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  34.74 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  28.25 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  29.84 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>